problema alle porte usb con windows?
ovvero è stato installato da te (ma più probabilmente da windows stesso in totale autonomia, cioè a tua insaputa) un driver di gestione usb (southbridge o controller terzo) problematico che fa malfunzionare le periferiche usb che colleghi al pc
^^^ hai mica provato con altre pendrive e/o altri dispositivi usb?
o quanto meno questa pendrive
comunque salva i dati, che sembrano importantissimi da come scrivi, almeno su altri due supporti diversi (almeno), tanto per stare dalla parte dei bottoni...
e fallo finchè puoi, non è escluso che sia proprio la pendrive a essere in procinto di salutarti
ciao ciao