Sì si può, esplicitando i caratteri "line terminator" (li ho presi da regex101, nello schemino di destra dove spiega il significato della regex, è nella descrizione del punto):
SET((.|[\r\n\u2028\u2029])*?)WHERE
Vedi esempio aggiornato dove ho rimosso il flag s:
https://regex101.com/r/qEmUG1/3