No, semplicemente perchè le WU di Rosetta macinano modelli per un tempo determinato dall'utente :D E di default è 3 ore, quindi per 3 ore macina modelli sulla WU, poi chiude e spedisce quelli fatti (ah non è che a 3 ore chiude e scarta quello a metà che sta facendo eh, lo porta a termine l'ultimo... non che di solito ci voglia molto). Più potente è il processore, più modelli fai in quel periodo e più punti fai
Puoi cambiare il periodo, 3 ore, 6 ore etc fino a 24ore... qua abbiamo 6ore noi di Flotta |
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Boh :mbe: |
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Ti danno un tot di tempo e più pacchetti sgretoli in quel tempo e più crediti ti danno. Ho capito........è un sistema diverso dal folding. E' per questo che non ci arrivavo...... |
Polpi si riferiva a folding :asd: E ciò che dice ha senso infatti, ma per folding...te invece parli di rosetta (folding non è su BOINC) :D
Yep, tra Folding e Rosetta c'è proprio una differenza di metodi, non sono due progetti identici, studiano le proteine ma con metodi diversi, diciamo che quello di Folding è più preciso e rigoroso perchè simula i movimenti della proteina passo passo fino alla fine, cosa che però è MOLTO MOLTO MOLTO pesante come richiesta di potenza di calcolo! Una proteina fa un sacco di movimenti casuali prima di trovare la sua forma finale Rosetta no, cerca la forma con minor energia, ovvero quella che alla fine assume la proteina (se faccio cader un qualcosa a terra, questo raggiunge la posizione con minor energia, ovvero a terra, non rimane sospeso a mezz'aria) e lo fa buttando a random milioni e milioni di tentativi (se guardi il grafico vedi che appunto ci son le strutture, una è la migliore di quel modello, una è l'ultima considerata valida e l'altra è quella attuale, che di solito cambia MOLTO velocemente (migliaia al secondo nella ricerca a bassa risoluzione, di meno quando passa poi a quella ad alta), non a caso ovviamente! Ma sfruttando algoritmi fatti apposta per beccare la struttura finale nel modo più efficiente possibile (il tentativo con la proteina a forma di pikachu ecco non lo tenta neanche) Funziona? Si e anche molto bene, come dimostrano i vari paper e i grafici dove sovrappongono la struttura simulata a quella reale |
edit: già chiarito
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Si si parlavo di rosetta........avevo anche specificato BOINC.
Ma non rosetta :fagiano: |
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Rosetta invece ti da un apcchetto e lo lavori per un tempo che decidi tu |
Che poi approfondendo, quelli di Folding ti dan la proteina e ti dicono "simulami cosa fanno i suoi atomi per questo tot di tempo", Rosetta invece "piglia sta proteina e ripiegala di modo da farmi dei modelli attinenti alla realtà, ti dò 3 ore (di default)"
Per questo per Folding è importante restituir la WU in fretta, il passaggio successivo non si può fare finchè non ritorna il risultato precedente Insomma, si monta la simulazione totale un pacchetto alla volta! E nel log file potete vedere all'inizio dell'elaborazione "run clone gen" che vi dice che punto del ramo dell'enorme albero della simulazione di quella proteina (ovviamente si portano avanti più simulazioni di una proteina, magari in un caso gli atomi decidono di piegarsi in un modo mentre nell'altra decidono di piegarsi di là, tutto è regolato dall'agitazione atomica, pura fisica!) fa parte la WU |
Capito........sono due modi diversi per fare la stessa cosa.
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Esatto, entrambi efficienti, mi preme di ricordare (insomma che non si venga a dire che rosetta è "ah quelli che fan le proteine tirando la monetina" :D )
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Ma no, apri il log file e cerca, non c'è niente da cliccare, è solo una curiosità
(in effetti messages è su boinc, su folding status-->log file ma il succo è quello) |
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Su ps3 invece è fatto molto meglio. In pratica pigiando un tasto ti dice tutta la descrizione della proteina che stai elaborando, che tipo è, a cosa serve e che risultato può restituire. Credo si possa fare anche con folding cpu e gpu. Ma non ho mai provato. |
Per pc se vai sul sito puoi cercare i vari progetti e ti dà una piccola descrizione
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No ragazzi c'è qualcosa che non va in boinc.
Adesso anche dopo un ora e mezzo mi da 100% WU completata. Pronta da riportare. Non è che l'overclock produce errori di calcolo e non finisce la WU? Ps: Noto ora che fra le opzioni di boinc c'è scritto "cambia applicazione ogni 60minuti". I minuti si possono cambiare a piacimento. Forse è questa che dopo 1 ora cambia WU e non è l'overclock?? |
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L'oc riduvce i tempi. io ho una serie dei WU di seti da 57 minuti che le finisco in 45/47 min |
Tutti gli orari sono GMT +1. Ora sono le: 13:16. |
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