[Rosetta] Topic ufficiale
BOINC.ITALY - TOPIC UFFICIALE PROGETTO ROSETTA@HOME (clicca QUA per la lista completa dei progetti seguiti da team) Ambito: Ricerca Medica Home page del progetto Informazioni generali sul progetto Introduzione: (da Wikipedia) Rosetta@home è un progetto di Calcolo distribuito per predire e architettare le strutture delle proteine. La sua sede è ai "Baker Laboratory" all'Università di Washington, e uno dei capi di questo progetto è David Baker (Professore di biochimica all'Università di Washington. Il progetto gira sulla piattaforma Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC). Scopo del progetto: (da Wikipedia) Lo scopo del progetto è quello di apprendere informazioni importanti sulle proteine per combattere malattie come HIV, Malaria, Cancro e il Morbo di Alzheimer. Altre informazioni ed approfondimenti: (dal sito ufficiale e in inglese)
Informazioni tecniche Stato del progetto e delle iscrizioni: Progetto attivo Iscrisioni aperte Requisiti minimi a livello hardware: Per partecipare al progetto è consigliato almeno un 500MHz (o equivalente), 256MB di memoria RAM (per ogni WU in elaborazione) e 200MB di spazio su disco fisso. Maggiori dettagli QUI. Screensaver: Lo screensaver mostra in tempo reale i dati della proteina, lo stato dell'avanzamento dell'elaborazione e tutte le varie informazioni tecniche. Disponibilità di Work Unit: Ottima Il lavoro è sempre disponibile. Raramente si possono verificare problemi o down in cui per brevi periodi non è possibile ottenere nuove work units. Una cache settata a 2 o 3 giorni assicura piena efficienza a un pc moderno che lavora 24h/7g. Seguire sempre questo thread per conoscere in anticipo eventuali down programmati e non rimanere senza lavoro. Down programmati: Nessuno Al momento non sono in programma down settimanali programmati. Potete controllare la situazione del progetto sulla home page tra le news e lo stato dei server QUI. Applicazioni disponibili: v5.64 per Windown/x86 (stabile) - rosetta_5.64_windows_intelx86.exe v5.64 per Windows/x86_64 (stabile - rosetta_5.64_windows_x86_64.exe v5.64 per Linux/x86 (stabile ma sono stati riscontrati frequenti errori di elaborazione durante l'utilizzo) - rosetta_5.64_i686-pc-linux-gnu v5.64 per Linux/x86_64 (stabile) - rosetta_5.64_x86_64-pc-linux-gnu v5.64 per Mac OS X (stabile) - rosetta_5.64_powerpc-apple-darwin v5.64 per Mac OX X/Intel (stabile) - rosetta_5.64_i686-apple-darwin Work units disponibili: (nome: taglia_download, taglia_upload, deadline, occupazione RAM) xxxKB - xxxB - 10 giorni - dai 100MB ai 200MB circa; N.B:
Tempi di elaborazione: La caratteristica di rosetta è che l'utente può scegliere il tempo di elaborazione delle WU dal pannello delle preferenze specifiche del progetto (Target CPU run time ). Di default è 3 ore, ma può essere modificata fino a 24 ore. Una via di mezzo accettabile potrebbe essere 6 o 8 ore. Effettuate i cambiamenti gradualmente, in modo da non avere problemi di deadline con le wu già scaricate. Assegnazione crediti: I crediti assegnati per le WU di Rosetta variano in base alla quantità di modelli elaborati. Più un PC è veloce, più modelli elaborerà nel tempo impostato per ogni WU e più crediti riceverà. Il quorum è settato a una sola WU con replicazione iniziale 1. Applicazioni ottimizzate: Nessuna Al momento non è previsto lo sviluppo di applicazioni ottimizzate ufficiali e i sorgenti dell'applicazione non sono ancora stati resi disponibili. Problemi e domande comuni:
Link utili: URL per l'Attach a Rosetta@home: http://boinc.bakerlab.org/rosetta (da copiare e incollare nel Boinc Manager) Link per effettuare il Join a BOINC.Italy su Rosetta@home Classifica interna del team BOINC.Italy su Rosetta@home Statistiche per Rosetta@home di BOINC.Italy su BOINCstats Referente/i per Rosetta@home: - Per qualsiasi problema riguardante questo progetto di calcolo distribuito, fare riferimento a questo thread ufficiale. Non c'è un referente ufficiale per questo progetto, se qualcuno è interessato a prendere l'incarico e vuole dare una mano diventando referente, può postarlo in questo thread o contattare GHz in PVT. |
Quello è semplicemente l'elenco di tutti coloro che hanno trovato la struttura della proteina con il minimo di energia (meno energia ha una proteina-->più è probabile che assuma quella forma, quindi una forma che richiede pochissima energia ha alte probabilità di apparire nella realtà rispetto a una che ne richiede di più ed è importante conoscerla)
Ogni utente elabora la sua WU con la proteina e gli fa assumere varie forme e ne calcola l'energia, evidentemente le forme per proteina sono tante e sono divise in varie WU, a chi capita la WU con la forma a minor energia di quella proteina...viene pubblicato lì :D |
ok, su questo c'ero, ma il punto è che questa volta è diverso, non c'è solo la predizione come al solito, ma hanno fatto un discorso più lungo e ci sono i nomi degli 8 fortunati che hanno beccato la giusta proteina.
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Ok? :D Quote:
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da assiduo scaccolatore di Rosetta nel team Boinc.Italy mi iscrivo alla discussione! Purtroppo stanotte parto e per 10 gg si interromperà lo scaccolamento, ma prometto faville computazionali per il mio ritorno!! :D
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eh, appartiene già al Rosetta Team Terni - Italy... :cry:
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Penso che in compagnia si troverà meglio :O :D Ho visto che hanno pubblicato anche i risultati e gli scaccolatori che hanno elaborato la WU migliore per CASP7 target T0363 domain 1! |
Rosetta@Home è un bel progetto, molto seguito dallo staff, con aggiornamenti e news frequenti, cose interessanti come le "top predictions" e altro, già per tutto questo, merita
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appunto ghz, era quello che mi aveva insospettito e mi aveva spinto ad aprire il topic, non è la solita predizione del giorno, ma qualcosa di più grosso e importante! :D
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Mi sono appena iscritto la progetto Rosetta. :D
Speriamo di dare una mano alla ricerca. bye bye Edito per chiedere una cosetta: Il pc ha finito di calcolare i primi 2 pacchetti che il client ha ricevuto, ha fatto l'aupload e ora lo status di quei pacchetti recita ready to report. Cosa devo fare?? Grazie Mi rispondo da solo.. non avevo letto uno dei tread in rilievo.. scusatemi |
Ho riscoperto Rosetta da un mese a questa parte, e dato il Rac impressionate della Flotta Stellare, direi di non essere l'unico nel mini-team! :D
E' bello inoltre vedere quante posizioni abbiamo fatto guadagnere a Boinc.Italy da quando abbiamo iniziato a scaccolare pesantemente sul progetto. :p E' senza dubbio un più "nobile" progetto rispetto al fratellone spaziale, senza nulla togliere a Seti naturalmente, ma sicuramente con risultati a più breve termine. Peccato solo che i media non diano mai spazio informativo alla piattaforma Boinc e i progetti sostenuti, con un pò più di pubblicità sono sicuro ci sarebbero molti più utenti in questa sezione del forum... :rolleyes: |
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BOINC è fatto apposta per far tutto in automatico, anzi, è meglio che non tocchi nulla e lasciargli fare ciò che le impostazioni che hai messo gli dicono di fare, magari hai messo di collegarsi solo ogni tot giorni o altro, quindi i 2 pacchetti sono finiti e ready to report ma non li ha ancora inviati |
a causa della scomparsa del funghetto eravamo calati parecchio, ma la botta di rac da 2500 e oltre hanno contribuito a risalire. Tornasse anche lui... :D
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Anche io sto scaccolando con Rosetta e con questo mi iscrivo alla discussione :)
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Ciao ragazzi siccome appoggio in pieno la CAUSA per il quale questo prgetto è nato, voglio dare il mio contributo.........
C'è solo un problema, non mi si connette. Quando mi fà scegliere il progetto io gli inserisco il link a rosetta ma m dice network comunication failure ( dice anche che può essere dovuto al firewall o alla mia connessione o che uso un proxy server per connettermi e che non ho inesrito il suo indirizzo. Ho disattivato tutto firewall antivirus, ma niente non si connette. he mi conisigliate di fare? Grazie a tutti |
Io invece non c'entro niente, ma ci voglio stare lo stesso :D :O . E poi non e' detto che in un lontano giorno di pioggia non giri un pc su rosetta. Intanto faccio il tifo e guardo dalla finestra :mano:
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nessuno mi può aiutare.....? please :(
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Io ti consiglio per prima cosa di rimettere istantaneamente antivirus e firewall se no il pc si trasforma seduta stante in una discarica
Poi...boh, magari è un virus o simile...fai qualche scansione con adaware-spybot-ewido, si sa mai.... |
avevo disattivato tutto solo per l'installazione ;) Ho appena finito un system scan con Kaspersky e non mi ha rilevato nulla........ :rolleyes:
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sei sicuro di aver messo bene il nome del progetto?
http://boinc.bakerlab.org/rosetta di preciso non saprei... magari il sommo Ghz... :help: |
ragazzi ho rifatto la procedura...........in pratica era l'orario che non mi permetteva di cottermi, nel senso che era tardi ieri sera e magari che sò.............. ora mi ha configurato tutto ed è partito eh eh.
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L'orario? :confused: Strano...............
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ma non sò perchè cmque. E VAI sto aiutando anche io sono al 10% e vaiiiiiiiiiii :D :D :D
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magari i server erano giù :O
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Benvenuto Cab123 nel fantastico mondo del calcolo distribuito allora :D |
Assie sono al 70% ormai, ma fatemi capire cosa sto ricercando? Lo sviluppo di una particolare proteina?
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stai contribuendo alla ricerca con l'università di Washington, per la scoperta di nuove cure per molte malattie.
Non so come te la cavi con l'inglese, ma a questo indirizzo http://boinc.bakerlab.org/rosetta/ra..._relevance.php trovi la lista delle malattie. I nomi sono in grassetto, quindi sono chiari. ;) |
guardate ragazzi non c'era cosa che mi potesse rendere più contento......dare un contributo intelligente con i nostri pc ad una causa per la quale solo anni di studi potrebbero renderti competente da poter ricercare e studiare. Con l'ausilio di un PC potremmo e diamo alla ricerca quella spinta in più che i governi ancora non danno. Che grande cosa :) :)
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Tutti noi qui siamo felici di dare un contributo alla ricerca con i nostri PC divertendoci ed imparando tante cose insieme, peccato che solo una piccola percentuale di persone conosca e contribuisca attivamente a qualche progetto di calcolo distribuito. Diffondi il verbo dello scaccolo e frusta i criceti :D P.S: hai fatto il join nel team BOINC.Italy? :cool: Ciao, GHz |
si sono nel boinc.italy ed ho avuto i primi crediti eh he :D
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Forse Rosetta tra tutti è il progetto "eticamente" più valido. Intanto... continuiamo a scaccolare! :read: |
io ci avevo provato con Rosetta e un mio amico era anche andato dal preside, ma il problema è che le scuole non hanno soldi (forse) e quindi hanno paura che si rompano i pc. Questo è quello che gli hanno detto.
In ogni caso andrebbe cmq considerato l'incremento del consumo di energia per un'intera aula di informatica. La soluzione è infettare di nascosto |
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Più che altro andrebbe considerato il fatto che a scuola sono presenti tribù di uomini preistorici......
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Dai che mooolto probabilmente domani arriva il pc nuovo
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